Во второй половине XVIII в. продолжалось военное противостояние России и Турции. Русские войска, занявшие Таганрог в апреле 1769 г., увидели обмелевшую гавань и руины бывшего города на мысу Таганий Рог. Начались восстановительные работы. Уже к осени 1770 г. гавань была готова к приему судов. Появились строения по плану 1769 г. Крепость восстанавливалась по планировке начала XVIII в. на фундаментах сооружений, разрушенных по указанию Петра I (по прусскому русско-турецкому договору от 12 июля 1711г.). Планировочная структура города-крепости сохранилась с петровского периода: вблизи гавани - строения адмиралтейского ведомства; вдоль внутреннего периметра крепостного вала размещались военные объекты; в центре города - площадь с торговыми рядами (рис. 20); остальная территория-форштадт предоставлялась ремесленникам и купцам и застраивалась бревенчатыми домами гражданского населения.
Рис. 20. Карта-схема Троицкой крепости на мысу Таганий Рог
Таганрог был восстановлен по типовому проекту городов- крепостей второй половины XVIII В.
На генеральном плане 1779 г., составленном инженер-полковником А. Ригелеманюм, форштадт получил преобладание над крепостью.
Город развивался медленно и больше "походил" на деревню. В 1782 г. в нем было 300 деревянных домов, три церкви: Михайловская, Никольская, Греческая.
Географически Таганрог располагается на полуострове, именуемом, в последствии, Миусским, который также следовало фортификационно укрепить. На западе у гирла Миусского лимана была возведена Семеновская крепость; на северо-западе - крепость Павловская, от которой, в сторону залива, в начале по суше, а затем по реке Большая Черепаха, тянулась цепь оборонительных сооружений, упиравшаяся в небольшую Черепашенскую крепость на северо-западном берегу залива.
На подступах к Петровской гавани с моря был насыпан искусственный остров Черепаха. В начале это была природная отмель в двух километрах от мыса Таганий Рог. По велению Петра I она была засыпана камнем, расширена, укреплена от расползания дубовыми сваями. Надводная часть, покрытая камнем, возвышалась над водой на 1,5 м. В длину остров был 59 м, в ширину - 37,5 м. В средней части - рубленная, крытая камышом изба "в три сажени" - для гарнизона. По велению Петра I, деревянные сооружения на о. Черепаха были заменены каменными.
Как цитадель остров потерял свое значение с окончанием войн с Турцией.
В 1746 г., когда в Таганроге: была открыта Таможенная застава, на о. Черепаха был ее дозор. В конце XVIII в. там был временный карантин для иностранных моряков. Далее остров оказался заброшенным и, со временем, размыт морем.
В 1886 г. на острове побывал Петр Ильич Чайковский, возможно с братом Ипполитом Чайковским. В 1916 г. остров часто посещал писатель К. Паустовский - удил здесь рыбу. Сейчас над отмелью возвышается навигационный знак. Под водой опасное "поле" камней. Глухими ударами корпуса моего добротного "Аиса" давали они о себе знать в непогоду. Обходите "останки" искусственного острова Черепаха стороною, подальше.
В судьбе Таганрога, полуостровного города, важная роль принадлежит морю, точнее Таганрогскому заливу Азовского моря. Именно море предопределило военно-стратегический и торгово-экологический статус города на мысу. Первый его официальный генеральный план возник в 1808 году, под руководством тогдашнего городского архитектора Амвросия Молла. Обширный и в общем прогрессивный генеральный план не был реализован в силу обстоятельств, существенно повлиявших на экономику города. Среди них неконкурентоспособность Таганрога с Одессой.
В 1834 г. возник новый генеральный план, реализация которого обеспечила композиционное единство города. К началу второй половины XIX в. Таганрог был полностью застроен В пределах плана 1808 г., и, что особенно важно, город хорошо вписывался в окружающую природу.
В "Материалах для географии и статистики России" это отражено следующим текстом: "Таганрог в Екатеринославской губернии может называться первым городом по величине и красоте построек...". Вглядитесь в старинные, сохранившие свое былое великолепие особняки на Греческой, Итальянской, Чеховской улицах города и вы убедитесь, что это именно так. Так это и сейчас.
В 1806 г., по ходатайству таганрогского градоначальника Б. Б. Компенгаузена (с 1805 по 1809 гг.), было разрешено начать планировку и закладку городского сада (ныне парк культуры и отдыха им. М. Горького, являющийся одним из лучших в России). Город утопал в зелени садов. Его промышленность располагалась на периферии, поближе к морю.
Генеральным планом развития города предусматривалось и углубление Петровской гавани. Через порт осуществлялся экспорт и импорт промышленных товаров. В городе функционировали крупные торговые фирмы: Ралли, Скараманга, Авьерино, Копора, Апенсопуло, Россы. Экспортировались российские промышленные товары в Средиземноморье. К 1860 г. здесь было 278 лавок, гостиный двор, три ярмарки: Никольская, Успенская, Михайловская.
К концу XIX века купеческий город становится городом индустриальным. К несчастью, упомянутые выше промышленные предприятия оказались первыми загрязнителями Таганрогского залива. И не потому, что экологической беды нельзя было избежать, а по небрежению людей к экологической опасности.